Сложившиеся тенденции пространственного развития в Российской Федерации определяют основные проблемы и вызовы:
1) Недостаточное количество центров экономического роста, их неравномерное распределение по территории Российской Федерации;
2) Несоответствие текущего уровня развития магистральной инфраструктуры потребностям экономики и населения субъектов Российской Федерации, низкая транспортная связанность центров экономического роста и других территорий между собой, нереализованный транзитный потенциал;
3) Возрастание демографической нагрузки на трудоспособное население в большинстве субъектов Российской Федерации;
4) Значительная доля малопроизводительных и низкотехнологичных отраслей в структуре экономик субъектов Российской Федерации;
5) Наличие существенных межрегиональных различий в качестве жизни населения, в том числе между геостратегическими и остальными территориями Российской Федерации;
6) Несбалансированное развитие крупнейших и крупных городских агломераций;
7) Нереализованный потенциал межрегионального и межмуниципального взаимодействия, низкий уровень кооперации между субъектами Российской Федерации и муниципальными образованиями;
8) Неудовлетворительное состояние окружающей среды в большинстве крупнейших и крупных городских агломераций и промышленных городах, напряженная экологическая ситуация на части крупных водных объектов, увеличение социально-экономического ущерба от последствий глобальных изменений климата, отсутствие единой системы мониторинга, контроля и управления экологическим каркасом на федеральном, региональном и муниципальном уровнях.